La verdadera razón por la que Sasuke posee solo un Rinnegan

A medida que se desarrollan las diversas historias de Naruto, el Rinnegan se despierta de forma natural y pura, cuando el usuario está listo. Sin embargo, en Sasuke se despertó gracias a la curación de Kabuto de una herida fatal usando células de Hashirama.

Para entender por qué Sasuke solo tiene un Rinnegan, hay que saber que lo recibió de una manera poco convencional. /

Cuando despertó el ojo izquierdo de Sasuke, la habilidad saltó algunos pasos en su creación, algo que puede ser positivo y contraproducente al mismo tiempo. Para despertar completamente a su Rinnegan, se necesitó la fuerza que le dio Hagoromo. Debido a esto, despertó el dojutso en un ojo y no el Rinnegan convencional que todos conoceremos

Sasuke a pesar de solo tener el Rinnegan en un solo ojo, posee todas las habilidades que este doujutsu le otorga a su usuario. /

La realidad es que no existe una explicación canónicamente precisa. Pero tiene mucho sentido creer que al recibir tanta "transmigración" desarrolló este Rinnegan que es único en la serie.